Страны и деревни настолько сильны только благодаря кланам, которые населяют их. Во всем мире уникальные техники передаются от поколения к поколению. Одни техники передаются генетически, другие известны только тем, кто принадлежит клану.

Клан Абураме (Aburame Clan)

Скрытая Деревня: Деревня листа
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Абураме Шино, Абураме Шиби
Способности: Kikaichuu no Jutsu

Этот клан из Деревни Коноха известен способностью управлять насекомыми. При рождении члены клана разрешают жукам жить в их теле и питаться чакрой. Взамен жуки дают возможность управлять ими.

Клан Акимичи (Akimichi Clan)

Скрытая Деревня: Деревня Листа
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Акимики Чоджи, Акимики Чойза
Способности: Baika no Jutsu

Этот клан из Деревни Конохи известен способностью изменять размер своего тела, увеличивая вес и превращаясь в шар. В этой форме сложно получить физический урон.

Клан Фуума (Fuuma Clan)

Местоположение: Страна Рисовых Полей
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Фуума Араши,Фуума Ханзаки, Фуума Сасаме,Фуума Джигумо,Фуума Кагерой, Фуума Камакири
Способности: Chakra no Ito

В предыдущие годы Орочимару прибыл в Страну Рисовых Полей, чтобы сделать там Деревню Скрытого Звука. Клан Фуума был в тяжелом положении со времени предыдущей войны Золотой и Серебряной Стран. Многие из клана решили присоединиться к Орочимару взамен на его обещание возрождение и укрепление клана Фуума.

Клан Хаку (Без названия)

Местоположение: Деревня Тумана
Классификация Jutsu: Родословные Техники
Члены клана: Хаку и его мать
Способности: Makyou Hyoushou

Этот клан из Деревни Тумана был известен способностью превращать воду в разные формы льда.
В стране тумана часто проходили войны, в результате чего во всех неприятностях обвинили шиноби. Так как в войнах участвовали в основном люди с измененным геномом, то за ними начали охоту. Когда отец Наку узнал об их способностях, то убил его мать и попытался убить его. Неизвестно, живы ли другие члены клана.

Клан Хьюга (Hyuuga Clan)

Скрытая Деревня: Деревня листа
Классификация Jutsu: Родословные Техники
Члены клана: Хьюга Неджи, Хьюга Хината, Хьюга Хизаши, Хьюга Хиаши, Хьюга Ханаби
Способности: Бьякуган

Этот клан из Деревни Листа известен способностью видеть потоки чакры у противника. Используя эту способность с другими техниками, они могут перекрывать потоки чакры, лишая противника возможности использовать чакру для выполнения техник.

Клан Инузука (Inuzuka Clan)

Скрытая Деревня: Деревня листа
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Инузука Киба, Инузука Тсуме, Инузука Хана
Способности: Shikyaku no Jutsu

Этот клан из Деревни Коноха известен связями с собаками. Многие члены клана имеют собаку, которая выступает партнером и помогает в бою. Также члены клана могут использовать техники, чтобы получить способности, подобные собакам.

Клан Кагуя (Kaguya Clan)

Местоположение: Деревня Тумана
Классификация Jutsu: Родословные Техники
Члены клана: Кагуя Кимимаро
Способности: Shikotsu Myaku

Клан Кагуя из Скрытого Тумана был известен любовью к сражениям. Они не могли жить без сражений и однажды напали на ближайших соседей. Но они переоценили свои силы, и весь клан был вырезан, выжил только один - Кимимаро. Этот клан имел способность управлять костной структурой. Они могли создавать новые кости, изменять их количество, вынимать их и использовать как оружие. Такие кости были сильнее стали.

Клан Камизуру (Kamizuru Clan)

Местоположение: Деревня Камня
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Камизуру Джибачи, Камизуру Куробачи, Камизуру Сузумебачи
Способности: Управление пчелами

В предыдущие годы клан Камизуру был очень влиятельным в Скрытом Камне. Во время войны они возглавили нападение на Коноху. На подходе к деревне их встретил клан Абураме. Тысячи погибли в том сражении, но победу одержал клан Абураме. Для клана Камизуру настали тяжелые времена. Спустя годы Джибачи, Куробачи и Сузумебачи отправляются в долину Бикочу, чтобы найти легендарного жука Бикочу. Это помогло бы им восстановить свое имя.
Три члена клана надеялись использовать Бикочу чтобы определить месторасположение запрещенного свитка, содержащего секретные техники использования жуков. С его помощью они смогли бы использовать техники более высокого уровня и выполнять более сложные задания. В результате они получили бы более высокое положение в деревне и восстановили былое величие клана.

Клан Нара (Nara Clan)

Скрытая Деревня: Деревня листа
Классификация Jutsu: Скрытые Техники
Члены клана: Нара Шикамару, Нара Шикаку, Нара Ешино
Способности: Техники теневого захвата и удушения

Этот клан из Деревни Коноха известен способностью управлять своей тенью. Используя эту способность, представитель клана может наложить свою тень на тень противника, тем самым взяв его под контроль. В таком состоянии цель повторяет все движения оппонента.

Сакон и Юкон (Sakon And Ukon)

Скрытая Деревня: Деревня Звука
Классификация Jutsu: Родословные Техники
Члены клана: Сакон, Юкон
Способности: Souma no Kou

Члены Четверки Звука Сакон и Юкон имеют способность изменять молекулы своего тела. Это позволяет им менять физические характеристики. Сакон, который первый упоминается в серии, фактически является комбинацией двух братьев - Сакона и Юкона. Братья делят одно тело на двоих. Когда Юкон входит во второй уровень проклятой печати, то он может вселяться в тело противника, убивая его изнутри. Вероятнее всего Сакон тоже может проделывать такой трюк.

Клан Учиха (Uchiha Clan)

Скрытая Деревня: Деревня листа
Классификация Jutsu: Родословные Техники
Члены клана: Учиха Саске, Учиха Итачи, Учиха Обито, Учиха Мадара и др.
Способности: Шаринган, Мангекё Шаринган

Этот клан из Деревни Коноха известен способностью копировать чужие техники и затем воспроизводить их по своему желанию. Члены клана имеют способность изменять свои глаза, чтобы принять форму Шарингана. Такими глазами они могут копировать движения тех, на кого смотрят. Это позволяет предугадывать действия противника.